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Validation of shRNA clones for gene silencing in 293FT cells

von Dr. Wen Wang

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Statistik und Sichtungsnachweis dieser Seite findet sich am Artikelende
[1.] Ww/Fragment 016 01 - Diskussion
Zuletzt bearbeitet: 2014-10-29 16:07:18 Hindemith
Fragment, Gesichtet, SMWFragment, Schutzlevel sysop, Stevenson 2004, Verschleierung, Ww

Typus
Verschleierung
Bearbeiter
SleepyHollow02
Gesichtet
Yes.png
Untersuchte Arbeit:
Seite: 16, Zeilen: 1-10
Quelle: Stevenson 2004
Seite(n): 1776, Zeilen: r.col: 12ff
[Therefore, a stoichiometric excess of a virus-specific siRNA, for] example, could saturate RNAi and interrupt the pathway’s normal functions in the cell. Interferons, which form part of the host’s defense against viral infection, are activated by long dsRNA (more than 500 bp). It is now apparent that siRNAs (Sledz et al, 2003) as well as shRNAs expressed from DNA vectors (Bridge et al, 2003) can trigger the activation of interferons. However, there is no evidence that the activation of interferons by short RNAs influences the degree or specificity of RNA silencing. In addition, these effects have to be reconciled with the manufacturing in cells of many thousands of copies of pre-miRNAs (Lagos et al, 2001) that do not appear to activate interferons. Therefore, a stoichiometric excess of a virus-specific siRNA, for example, could saturate RNAi and interrupt the pathway's normal functions in the cell.

Interferons, which form part of the host's defense against viral infection, are activated by long dsRNA (more than 500 bp). It is now apparent that siRNAs45 as well as short hairpin RNAs (short sequences of RNA that make tight hairpin turns and can be used to silence gene expression) expressed from DNA vectors46 can trigger the activation of interferons. However, there is no evidence that the activation of interferons by short RNAs influences the degree or specificity of RNA silencing. In addition, these effects have to be reconciled with the manufacturing in cells of many thousands of copies of pre-micro RNAs47,48,49 that do not appear to activate interferons.


45. Sledz CA, Holko M, de Veer MJ, Silverman RH, Williams BR. Activation of the interferon system by short-interfering RNAs. Nat Cell Biol 2003;5:834-9.

46. Bridge AJ, Pebernard S, Ducraux A, Nicoulaz AL, Iggo R. Induction of an interferon response by RNAi vectors in mammalian cells. Nat Genet 2003;34:263-4.

47. Lau NC, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP. An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans. Science 2001;294:858-62.

48. Lee RC, Ambros V. An extensive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans. Science 2001;294:862-4.

49. Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T. Identification of novel genes coding for small expressed RNAs. Science 2001;294:853-8.

Anmerkungen

Kein Hinweis auf die Quelle.

Sichter
(SleepyHollow02), Hindemith


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Letzte Bearbeitung dieser Seite: durch Benutzer:Hindemith, Zeitstempel: 20141029160747


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